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HDF5 ist eine Technologie, die das Management von außerordentliche groß und komplexe Daten ermöglicht. Man hat einen ortsveränderlichen Format mit schnittstellen zu den C/C++, Fortran und Java Programmiersprachen.
Verfügbar auf:
HDF5 ist unter /sw/aws/dataformats/hdf5/ installiert. Dieses Paket wurde mit GCC-4.1 übersetzt. Man konnte konnte leider nicht --enable-fortran, --enable-cxx oder --enable-parallel benutzen weil das passt nicht zu --enable-threadsafe zusammen. Die Übersetzungszeile war:
CC=gcc CXX=g++ FC=gfortran ./configure --prefix=/opt/sw/dataformats/hdf5/hdf5-1.8.1-gnu --with-pthread --enable-threadsafe
Um dieses Paket zu benutzen, muss man das Modul laden. Dies macht man so:
module load hdf5
Falls Sie die Fehlermeldung "module: command not found" bekommen, müssen Sie dieses Kommando eingeben (im normalen Fall ist das "module" Kommando bereits vorhanden):
source /usr/share/Modules/init/`basename $SHELL`
Leibniz Universität IT Services - URL: www.rrzn.uni-hannover.de/hdf5.html
Dr Paul Cochrane, Letzte Änderung: 08.11.2009
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