HDF5 (Hierarchical Data Format)

Beschreibung

HDF5 ist eine Technologie, die das Management von außerordentliche groß und komplexe Daten ermöglicht.  Man hat einen ortsveränderlichen Format mit schnittstellen zu den C/C++, Fortran und Java Programmiersprachen.

Verfügbar auf:

• RRZN-Computeservern

Ansprechpartner

  Dr. Paul Cochrane

Inhaltsverzeichnis

• Allgemeines
• Funktionalität
• Installation auf den RRZN-Computeservern
• Benutzung auf den RRZN-Computeservern
• Dokumentation und Beispiele

Allgemeines

Funktionalität

Installation auf den RRZN-Computeservern

HDF5 ist unter /sw/aws/dataformats/hdf5/ installiert.  Dieses Paket wurde mit GCC-4.1 übersetzt.  Man konnte konnte leider nicht --enable-fortran, --enable-cxx oder --enable-parallel benutzen weil das passt nicht zu --enable-threadsafe zusammen.  Die Übersetzungszeile war:

CC=gcc CXX=g++ FC=gfortran ./configure --prefix=/opt/sw/dataformats/hdf5/hdf5-1.8.1-gnu --with-pthread --enable-threadsafe

Benutzung auf den RRZN-Computeservern

Um dieses Paket zu benutzen, muss man das Modul laden.  Dies macht man so:

module load hdf5

Falls Sie die Fehlermeldung "module: command not found" bekommen, müssen Sie dieses Kommando eingeben (im normalen Fall ist das "module" Kommando bereits vorhanden):

source /usr/share/Modules/init/`basename $SHELL`

Dokumentation und Beispiele

• HDF Hauptseite
• Wikipedia-Eintrag