Perl-Fehler in qsub
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Written on: 19. 10. 2012 [02:12]
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nhaeruth
Julian Rüth
Topic creator
registered since: 25.08.2011
Posts: 16
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Das folgende Kommando liefert seit heute einige Perl-Fehler: $ qsub -N t13617-matrix_mod_pn-HEAD -M rueth  math.uni-hannover[dot]de -m ae -j oe -q all -W x=PARTITION:tane -l nodes=1:ppn=10 -l walltime=0:0:21:33 -l mem=10240mb -v COMMIT,BRANCH,CPUS,SAGE_OPTS,DIRS ~/jobs/doctest.jobUse of uninitialized value in substitution (s///) at /usr/local/sbin/torque_submitfilter line 442, <> line 17. Use of uninitialized value in scalar chomp at /usr/local/sbin/torque_submitfilter line 443, <> line 17. Use of uninitialized value in pattern match (m//) at /usr/local/sbin/torque_submitfilter line 447, <> line 17. Use of uninitialized value in split at /usr/local/sbin/torque_submitfilter line 457, <> line 17. Use of uninitialized value in pattern match (m//) at /usr/local/sbin/torque_submitfilter line 461, <> line 17. Use of uninitialized value in pattern match (m//) at /usr/local/sbin/torque_submitfilter line 461, <> line 17. Use of uninitialized value in pattern match (m//) at /usr/local/sbin/torque_submitfilter line 461, <> line 17. Use of uninitialized value in substitution (s///) at /usr/local/sbin/torque_submitfilter line 487, <> line 17. Use of uninitialized value in scalar chomp at /usr/local/sbin/torque_submitfilter line 488, <> line 17. Use of uninitialized value in pattern match (m//) at /usr/local/sbin/torque_submitfilter line 492, <> line 17. Use of uninitialized value in split at /usr/local/sbin/torque_submitfilter line 498, <> line 17. Use of uninitialized value in split at /usr/local/sbin/torque_submitfilter line 503, <> line 17. Use of uninitialized value in multiplication (*) at /usr/local/sbin/torque_submitfilter line 220, <> line 17. Use of uninitialized value in numeric gt (>  at /usr/local/sbin/torque_submitfilter line 220, <> line 17.Use of uninitialized value in multiplication (*) at /usr/local/sbin/torque_submitfilter line 285, <> line 17. Use of uninitialized value in numeric gt (> at /usr/local/sbin/torque_submitfilter line 285, <> line 17.ACHTUNG / WARNING: 'mem' parameter not present; the default value will be used (1800mb) 'walltime' parameter not present; the default value will be used (24:00:00) 'nodes' parameter not present; the default value will be used (nodes=1:ppn=1) Hat sich an dem torque_submitfilter etwas geändert? Danke, julian |
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Written on: 19. 10. 2012 [09:06]
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gerdes
Andreas Gerdes
registered since: 14.09.2010
Posts: 50
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Hallo Julian, in der Tat wurde kürzlich ein Spezialfall aufgefangen und Torque-Submitfilter angepasst. Wir kümmern uns drum. Danke für die Nachricht! Andreas |
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Written on: 20. 10. 2012 [02:18]
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nhaeruth
Julian Rüth
Topic creator
registered since: 25.08.2011
Posts: 16
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Ich habe jetzt um das herumgebaut, indem ich die Werte in die Job-Datei schreibe. Das Problem scheint zu sein, dass die while(@ARGV)-Schleife die "-l" Paramter ignoriert, anstatt sie in @PBS_l_lines einzutragen. |
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Written on: 21. 10. 2012 [12:45]
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cochrane
Paul Cochrane
registered since: 14.09.2010
Posts: 145
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Hallo Julian, ja, da habe ich etwas geändert damit manche Jobs nicht in die Queue abgesetzt werden können wenn die eigentlich nie anlaufen werden. Leider kommt der Code nicht mehr so klar mit Eingaben an der Kommandozeile. Ich bin dabei diese Probleme zu lösen aber bin ab heute auf einer Dienstreise so es könnte bis mindestens Mittwoch dauern bis ich alle Bugs herausgebügelt habe. Viele Grüße, Paul |
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Written on: 24. 10. 2012 [15:27]
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gerdes
Andreas Gerdes
registered since: 14.09.2010
Posts: 50
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Hallo Julian, wir sind gerade erst mal zur letzten stabilen Version des Torque-Submit-Filters zurückgekehrt, so dass jetzt alle Jobs erst mal wieder angenommen werden so wie früher. Wir arbeiten derweil daran, die Änderungen auf für interaktive Jobs fest zu machen. Sorry für die Umstände. Viele Grüße Andreas |
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