|
|
|
|
|
|
Programm/Software/Climate Data Operators installieren
| Author |
Message |
|
Written on: 21. 12. 2011 [12:34]
|
|
hhoffmann
Holger Hoffmann
Topic creator
registered since: 21.12.2011
Posts: 30
|
Hi,
Wie muss ich vorgehen um Software auf dem Cluster installieren? In den User-Anleitungen/Seiten des RRZN habe ich diesbezüglich nichts gefunden.
Hintergrund: Um Klimadaten im ".ieg" bzw. ".nc" (netcdf)-Format zu verarbeiten benötige ich das Programm "Climate Data Operators" (CDO) mit netcdf support:
https://code.zmaw.de/projects/cdo
(https://code.zmaw.de/files/cdo/html/1.5.2/cdo.pdf)
Gruß,
Holger
|
|
Written on: 21. 12. 2011 [12:44]
|
|
gerdes
Andreas Gerdes
registered since: 14.09.2010
Posts: 50
|
Hallo Holger,
Du kannst den Tarball von der Homepage einfach nehmen und in Deinem Homeverzeichnis übersetzen. Compiler & Tools stehen als Modules bereit. Es gibt auch ein Module netcdf für die Library. Die wird das Programm wahrscheinlich brauchen:
zzzzgerd@avon:~$ module av net
------- /sw/modulefiles ------------
netcdf/4.0
zzzzgerd@avon:~$
Wenn der Bedarf größer wird für das Programm, können wir es auch zentral als Module bereitstellen. Vielleicht antworten noch anderere User in diesem Thread, dann lässt sich der Bedarf abschätzen...
Wir schauen uns die Software gerne mal an und installieren Sie dann zentral. Vor Weihnachten wird das wahrscheinlich nichts, und nächste Woche sind Wartungsarbeiten am Cluster. Aber wenn Ende nächster Woche alles wieder läuft, dann melde ich mich nochmal.
Viele Grüße und schöne Feiertage
Andreas
|
|
Written on: 21. 12. 2011 [19:49]
|
|
hhoffmann
Holger Hoffmann
Topic creator
registered since: 21.12.2011
Posts: 30
|
Hi Andreas,
thx 4 the fast answer.
>./configure --with-netcdf=/sw/modulefiles/netcdf/4.0
>make
seem to work fine, but
>make install
delivered the following permission error:
Making install in libcdi
make[1]: Entering directory `/home/nhpghoff/cdo-1.5.3/libcdi'
Making install in src
make[2]: Entering directory `/home/nhpghoff/cdo-1.5.3/libcdi/src'
make[3]: Entering directory `/home/nhpghoff/cdo-1.5.3/libcdi/src'
/bin/sh ../config/mkinstalldirs "/usr/local/lib/pkgconfig"
mkdir -p -- /usr/local/lib/pkgconfig
mkdir: cannot create directory `/usr/local/lib/pkgconfig': Permission denied
make[3]: *** [install-exec-local] Error 1
make[3]: Leaving directory `/home/nhpghoff/cdo-1.5.3/libcdi/src'
make[2]: *** [install-am] Error 2
make[2]: Leaving directory `/home/nhpghoff/cdo-1.5.3/libcdi/src'
make[1]: *** [install-recursive] Error 1
make[1]: Leaving directory `/home/nhpghoff/cdo-1.5.3/libcdi'
make: *** [install-recursive] Error 1
Any idea?
Kind regards,
Holger
|
|
Written on: 23. 12. 2011 [14:13]
|
|
hhoffmann
Holger Hoffmann
Topic creator
registered since: 21.12.2011
Posts: 30
|
Hi,
sorry, I had forgotten to add the prefix:
./configure --with-netcdf=/sw/modulefiles/netcdf/4.0 --prefix=/home/nhpghoff/cdo-1.5.3/
Anyway, it would be nice to have cdo as a module, available to all users.
Kind regards,
Holger
|
|
User login
Enter your username and password here in order to log in on the website:
Falls Sie noch keinen Benutzer-Zugang zu dem Forum haben, können Sie sich jederzeit registrieren:
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Editorial Responsibility RRZN
|
|
Top
Print